いつもありがたく使わせていただいております。
Ver2.21.1で下記操作を行うと「システム エラー。コード: 1400。ウィンドウ ハンドルが無効です。」が発生します。

１）ファイルメニューから「SQLに名前を付けて保存」を選択
２）保存ダイアログでエンコードディングを変更する
３）［キャンセル］ボタンを押下してダイアログを閉じる
４）ファイルメニューから「SQLに名前を付けて保存」を選択

エラーを［ＯＫ］ボタンで閉じてから再度やり直したら保存ダイアログが出るので、
実害は特にありませんが、ご報告させていただきます。

以上、よろしくお願いいたします。