がーこさんこんにちは。
一応、仮想マシンのWindows 7 SP1で試してみたのですが、正常に動作しているように思えました。
A5:SQL Mk-2のタイトルバーが、タスクバーと重なって見えなくなるという現象でしょうか?。
タイトルバーがタスクバーに隠れるようにウィンドウを移動させると、押し出されるようにタスクバーの下に配置されます。多分、Windowsの標準の機能のようにも思えるのですが…。
もしかしたら、Windowsのサービスパックの状態などにも依存しそうな気がするのですが如何でしょうか。その辺の情報などもいただけるとありがたいです。