COSさんこんにちは。
　
ER図上で適用したい（変更した）エンティティを選択し、メニューから [ER図(D)] – [DDLを作成する(D)…]を選択します。
　
以下２つのチェックボックスをオンにします。（なっていなければ）
　「Create tableの前にDrop tableステートメントを生成する」
　「選択しているオブジェクトだけDDLを生成する」
　
これで「DDL生成」ボタンを押下すれば、該当のテーブルに対するDROP TABLEとCREATE TABLEが生成されます。それぞれ、「–* BackupToTempTable」と「–* RestoreFromTempTable」の疑似命令が付いているので、DROP TABLEの前にテンポラリテーブルにデータが保存され、CREATE TABLE後にデータが復元されるようになります。
（一般的にはテーブルを作り直すとデータは消失します。また、A5:SQL Mk-2以外からこのDDLを実行してもデータは消失します。）
　
あと、データベースによっては参照整合性制約などがかけられていると、DROP TABLEに失敗することがあるので、注意が必要です。
　
テーブルに紐づいたトリガーなどが消えてしまう場合もありますし、基本的にはデータベースに管理者が別にいる場合、相談してから実行したほうが良いかと思います。