DBにSQLite3を使用した場合、クエリの実行計画が取得できないようです。
当方の環境は、
１．以下の公式サイトよりダウンロード
　　https://system.data.sqlite.org/index.html/doc/trunk/www/downloads.wiki
　　→ Precompiled Binaries for 64-bit Windows (.NET Framework 4.6)
　　→ sqlite-netFx46-binary-x64-2015-1.0.112.0.zip
２．DBおよびテーブルを作成
３．クエリ画面で
　　explain query plan select * from table
　　を実行
４．ステータスバーに「-1件のレコードを更新しました」となり、実行計画が表示されない

旧バージョンの2.13.3までは正常に実行計画が表示されますが、2.14.4以降は表示されないようです。
（32bit版/64bit版ともになります）
お手数ですが、ご確認お願い致します。